Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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H3F3AP84243 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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H3F3AP84243 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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H3F3AP84243 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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H3F3AP84243 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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H3F3AP84243 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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H3F3AP84243 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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