Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2P78314 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms