Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP46P62068 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP46P62068 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP46P62068 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP46P62068 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP46P62068 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP46P62068 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP46P62068 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP46P62068 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP46P62068 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP46P62068 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
USP46P62068 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP46P62068 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP46P62068 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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USP46P62068 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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USP46P62068 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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USP46P62068 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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USP46P62068 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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USP46P62068 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP46P62068 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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USP46P62068 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP46P62068 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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