Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TBX4P57082 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TBX4P57082 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TBX4P57082 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TBX4P57082 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms