Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCKAP1LP55160 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms