Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms