Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms