Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB28P51157 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB28P51157 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms