Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF6P49848 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF6P49848 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF6P49848 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF6P49848 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF6P49848 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms