Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP4P49662 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP4P49662 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms