Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NESP48681 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NESP48681 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NESP48681 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms