Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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