Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms