Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms