Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXLNAP40222 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms