Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM23P36406 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms