Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC8A1P32418 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms