Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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