Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms