Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRMP28827 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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