Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms