Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMO2P25791 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMO2P25791 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMO2P25791 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO2P25791 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms