Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms