Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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