Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPREP23469 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPREP23469 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPREP23469 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPREP23469 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms