Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRDP23468 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms