Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA6P23229 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms