Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATF6P18850 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF6P18850 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF6P18850 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF6P18850 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF6P18850 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF6P18850 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF6P18850 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATF6P18850 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF6P18850 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF6P18850 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF6P18850 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATF6P18850 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms