Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB6P18564 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms