Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCP1P17987 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms