Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms