Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYBBP04839 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYBBP04839 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYBBP04839 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYBBP04839 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYBBP04839 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYBBP04839 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYBBP04839 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms