Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms