Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1AO95602 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1AO95602 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1AO95602 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms