Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAPGEF3O95398 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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