Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKAP2O75563 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKAP2O75563 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms