Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR5O60602 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms