Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN4O43707 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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