Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms