Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CACNA1GO43497 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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