Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms