Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGSM2O43147 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms