Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms