Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PCH4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PCH4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PCH4 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PCH4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PCH4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PCH4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PCH4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PCH4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PCH4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PCH4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PCH4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms