Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms