Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms