Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC12A4Q9UP95 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC12A4Q9UP95 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms