Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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