Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBE1Q9UJT0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms