Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLKQ9UBT6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLKQ9UBT6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms